More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0468 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.63 
 
 		 256 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.02 
 
 		 257 aa  335  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.02 
 
 		 258 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.1 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.06 
 
 		 262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.48 
 
 		 259 aa  307  9e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.46 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.9 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.98 
 
 		 266 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.68 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.94 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.16 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.35 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.88 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  50.94 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.8 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.74 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.56 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.31 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.47 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.76 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.02 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.31 
 
 		 285 aa  191  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.31 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.12 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.37 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.98 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.57 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.44 
 
 		 266 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.03 
 
 		 267 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.03 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.62 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.53 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.64 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.68 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.28 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.67 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.25 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.44 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.62 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.74 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.57 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.87 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42 
 
 		 270 aa  184  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.02 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.21 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.21 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.21 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.67 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.9 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.55 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.4 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.74 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.08 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.74 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.79 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.48 
 
 		 271 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.27 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.63 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.09 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.74 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.16 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.27 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.39 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.03 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.06 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.67 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.74 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.39 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.32 
 
 		 295 aa  178  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.33 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.83 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.7 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.63 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>