More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0478 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.31 
 
 
258 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 
273 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.64 
 
 
275 aa  205  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.67 
 
 
268 aa  204  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.69 
 
 
271 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.77 
 
 
270 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.13 
 
 
259 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.83 
 
 
259 aa  202  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.83 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.25 
 
 
294 aa  199  5e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
262 aa  199  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.24 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.38 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.5 
 
 
269 aa  195  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 
262 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 
285 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  49 
 
 
259 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 
269 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.5 
 
 
281 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.23 
 
 
265 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  48.02 
 
 
355 aa  192  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 
268 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.29 
 
 
266 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.24 
 
 
265 aa  191  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.84 
 
 
266 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.98 
 
 
262 aa  191  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
271 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
268 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46 
 
 
265 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.17 
 
 
268 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1443  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.79 
 
 
295 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.810635  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.24 
 
 
295 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.69 
 
 
266 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.9 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
266 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.54 
 
 
266 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.87 
 
 
295 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.94 
 
 
267 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 
261 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 
278 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.86 
 
 
273 aa  188  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
266 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.08 
 
 
270 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.53 
 
 
265 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 
278 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.89 
 
 
265 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
258 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 
278 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.89 
 
 
263 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.23 
 
 
265 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.91 
 
 
271 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.78 
 
 
267 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
294 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
258 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
271 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.85 
 
 
271 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.49 
 
 
256 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.89 
 
 
270 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.92 
 
 
266 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.54 
 
 
271 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  45 
 
 
262 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.02 
 
 
278 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.79 
 
 
267 aa  185  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
276 aa  185  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
272 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.54 
 
 
259 aa  184  9e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.17 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.94 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.78 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.56 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.96 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.63 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.02 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.62 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.92 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
285 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
285 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.37 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.28 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.63 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.14 
 
 
270 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.85 
 
 
270 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
277 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
296 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.05 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>