More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0531 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.59 
 
 
258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.28 
 
 
256 aa  331  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.26 
 
 
257 aa  324  9e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.57 
 
 
262 aa  316  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.92 
 
 
258 aa  313  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.78 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.85 
 
 
259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  52.29 
 
 
259 aa  208  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
259 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
266 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.43 
 
 
259 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.43 
 
 
259 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.16 
 
 
271 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.43 
 
 
260 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.27 
 
 
260 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.6 
 
 
266 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
285 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.8 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
266 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.37 
 
 
295 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.08 
 
 
288 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.38 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.39 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.99 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.95 
 
 
264 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.25 
 
 
266 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.58 
 
 
267 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.48 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.8 
 
 
271 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.48 
 
 
258 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
285 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
285 aa  195  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
275 aa  194  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.25 
 
 
260 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
278 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.44 
 
 
265 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.35 
 
 
264 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.18 
 
 
265 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.27 
 
 
261 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
285 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.62 
 
 
267 aa  191  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.91 
 
 
287 aa  191  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.57 
 
 
262 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.9 
 
 
262 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.71 
 
 
263 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.48 
 
 
258 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
266 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 
265 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.55 
 
 
271 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 
264 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.2 
 
 
271 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.2 
 
 
265 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
273 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.5 
 
 
267 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.18 
 
 
270 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.27 
 
 
265 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
264 aa  185  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.94 
 
 
267 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.23 
 
 
265 aa  185  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.84 
 
 
266 aa  185  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.21 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.89 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.84 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.27 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.57 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.49 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.14 
 
 
269 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
295 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.76 
 
 
263 aa  183  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
266 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.15 
 
 
264 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
258 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.65 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.4 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.13 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.05 
 
 
278 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.64 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.64 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.99 
 
 
266 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.23 
 
 
258 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
268 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0359  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.96 
 
 
260 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.56085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.91 
 
 
267 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.32 
 
 
262 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
263 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.23 
 
 
258 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.55 
 
 
261 aa  180  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 
265 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 
266 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
263 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
271 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.37 
 
 
268 aa  178  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.31 
 
 
264 aa  178  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
269 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>