More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0594 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  100 
 
 
278 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  89.57 
 
 
278 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  84.33 
 
 
277 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.29 
 
 
278 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.96 
 
 
277 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.96 
 
 
277 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.72 
 
 
278 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.72 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.96 
 
 
277 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  81.45 
 
 
279 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.57 
 
 
266 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  64.89 
 
 
265 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  64.12 
 
 
265 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.62 
 
 
265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.23 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.6 
 
 
269 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.45 
 
 
270 aa  322  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.07 
 
 
271 aa  319  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.93 
 
 
265 aa  318  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.6 
 
 
264 aa  317  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.6 
 
 
264 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  60.46 
 
 
267 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.12 
 
 
270 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.95 
 
 
267 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.93 
 
 
271 aa  305  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  63.12 
 
 
270 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.47 
 
 
267 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.62 
 
 
261 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.39 
 
 
271 aa  295  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  60.67 
 
 
267 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.93 
 
 
267 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.77 
 
 
261 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.07 
 
 
262 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.38 
 
 
261 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.92 
 
 
267 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.46 
 
 
263 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  62.16 
 
 
262 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.46 
 
 
263 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.03 
 
 
266 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.31 
 
 
261 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.23 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.11 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.89 
 
 
266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.3 
 
 
264 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.46 
 
 
262 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.77 
 
 
261 aa  278  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.890478  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.15 
 
 
261 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.06 
 
 
285 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.89 
 
 
266 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.15 
 
 
261 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63 
 
 
266 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.06 
 
 
285 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.38 
 
 
261 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.77 
 
 
261 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.883215 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.38 
 
 
261 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.38 
 
 
261 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.77 
 
 
261 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.77 
 
 
261 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.38 
 
 
261 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.37 
 
 
267 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.51 
 
 
266 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.18 
 
 
267 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.38 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.92 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.31 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.3 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3618  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.54 
 
 
261 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  54.75 
 
 
288 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.6 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.98 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.12 
 
 
279 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.62 
 
 
267 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.56 
 
 
285 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1443  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.23 
 
 
295 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.810635  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.31 
 
 
295 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.37 
 
 
272 aa  266  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 
295 aa  263  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.89 
 
 
266 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.18 
 
 
270 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.89 
 
 
267 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.02 
 
 
263 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.41 
 
 
266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.2 
 
 
269 aa  251  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.56 
 
 
270 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.82 
 
 
268 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 
258 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.49 
 
 
265 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.74 
 
 
262 aa  246  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.65 
 
 
266 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.42 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.42 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.46 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.23 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.6 
 
 
276 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.93 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
278 aa  241  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 
265 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.03 
 
 
287 aa  241  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>