More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0359 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0359  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.56085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.91 
 
 
265 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.86 
 
 
265 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.82 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.96 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.8 
 
 
258 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.92 
 
 
268 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
266 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.78 
 
 
262 aa  191  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
275 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.83 
 
 
256 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.85 
 
 
260 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 
267 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
271 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.54 
 
 
271 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  42.64 
 
 
259 aa  188  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.2 
 
 
260 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.51 
 
 
262 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.51 
 
 
270 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
269 aa  184  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.39 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.77 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.7 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.81 
 
 
264 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.86 
 
 
264 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.31 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.62 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.86 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.39 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.5 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.02 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.23 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
266 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.96 
 
 
258 aa  181  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.78 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
267 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.5 
 
 
266 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.76 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.77 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
270 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.47 
 
 
267 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.2 
 
 
259 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.72 
 
 
267 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.93 
 
 
271 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.81 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.59 
 
 
271 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.95 
 
 
266 aa  178  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.95 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.48 
 
 
259 aa  178  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.77 
 
 
267 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.61 
 
 
259 aa  178  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.19 
 
 
274 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.73 
 
 
259 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 
262 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.93 
 
 
267 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.23 
 
 
263 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
270 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 
266 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.32 
 
 
258 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
261 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.88 
 
 
267 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
285 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.45 
 
 
266 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.63 
 
 
295 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.32 
 
 
288 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.91 
 
 
262 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
269 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.7 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.19 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.56 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.21 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.41 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.16 
 
 
278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.58 
 
 
267 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
258 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
261 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.07 
 
 
272 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.98 
 
 
268 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 
261 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.883215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.6 
 
 
264 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 
261 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.5 
 
 
261 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 
261 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>