More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2380 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  88.72 
 
 		 266 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.56 
 
 		 268 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.09 
 
 		 266 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.42 
 
 		 266 aa  384  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.54 
 
 		 266 aa  377  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.65 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.62 
 
 		 266 aa  278  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.49 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.47 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.17 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.51 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.58 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.13 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.44 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.35 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.64 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.38 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.31 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.56 
 
 		 266 aa  255  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.69 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.92 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.05 
 
 		 261 aa  254  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.79 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.46 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.46 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.51 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.23 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.02 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.45 
 
 		 267 aa  251  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.85 
 
 		 264 aa  251  7e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.13 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.02 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.31 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.09 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.37 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.53 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.23 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.47 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.02 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.67 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.11 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.11 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.23 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.08 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.23 
 
 		 270 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.54 
 
 		 261 aa  244  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.54 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.54 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.49 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.54 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.96 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.89 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.23 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.7 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.85 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.81 
 
 		 266 aa  241  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.77 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.77 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.77 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.77 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.59 
 
 		 261 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.72 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  50 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.23 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.32 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.31 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.26 
 
 		 272 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.76 
 
 		 268 aa  238  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.95 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.69 
 
 		 271 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.75 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.71 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.49 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  51.15 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.71 
 
 		 278 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.92 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.47 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.08 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.64 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.71 
 
 		 278 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3618  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.44 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.883215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.58 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.44 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.47 
 
 		 259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.44 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.58 
 
 		 267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.13 
 
 		 268 aa  231  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>