More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1650 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
262 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.06 
 
 
258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.27 
 
 
256 aa  323  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.45 
 
 
257 aa  317  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.57 
 
 
258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.6 
 
 
258 aa  304  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.82 
 
 
259 aa  276  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.8 
 
 
259 aa  221  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.4 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.2 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
266 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.6 
 
 
265 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.81 
 
 
266 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.6 
 
 
264 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.01 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.39 
 
 
265 aa  214  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.8 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.21 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.19 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.4 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.01 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.41 
 
 
266 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.37 
 
 
272 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.21 
 
 
285 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
260 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.25 
 
 
271 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.52 
 
 
259 aa  207  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.52 
 
 
259 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 
266 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.88 
 
 
285 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.88 
 
 
285 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  48.03 
 
 
288 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.18 
 
 
265 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.25 
 
 
267 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.25 
 
 
259 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.39 
 
 
269 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.49 
 
 
285 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
263 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.01 
 
 
265 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.23 
 
 
260 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.43 
 
 
267 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.18 
 
 
264 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.58 
 
 
260 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.18 
 
 
264 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
267 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.25 
 
 
262 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.79 
 
 
265 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.91 
 
 
271 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.85 
 
 
271 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.41 
 
 
265 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.77 
 
 
264 aa  201  9e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.48 
 
 
260 aa  201  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
266 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.59 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.25 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 
262 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.31 
 
 
270 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.06 
 
 
269 aa  198  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.68 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.4 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.24 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.56 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.46 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.96 
 
 
287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.39 
 
 
261 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.31 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.27 
 
 
258 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.56 
 
 
267 aa  195  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
260 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
259 aa  195  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.32 
 
 
275 aa  194  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.67 
 
 
268 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.91 
 
 
264 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.56 
 
 
266 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
277 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.3 
 
 
267 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.95 
 
 
271 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.85 
 
 
264 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.39 
 
 
270 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.56 
 
 
266 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.58 
 
 
267 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.3 
 
 
267 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.31 
 
 
281 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.69 
 
 
261 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.62 
 
 
268 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.75 
 
 
268 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.22 
 
 
272 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 
281 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.27 
 
 
266 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
277 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
277 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 
266 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.34 
 
 
294 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 
267 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 
267 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.64 
 
 
267 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.46 
 
 
272 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.67 
 
 
258 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.21 
 
 
273 aa  188  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.77 
 
 
258 aa  188  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>