More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1254 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.78 
 
 
259 aa  434  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.78 
 
 
259 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.76 
 
 
266 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.55 
 
 
259 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
267 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
268 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.33 
 
 
266 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.56 
 
 
266 aa  225  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 
258 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 
258 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.13 
 
 
258 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
269 aa  221  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 
272 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.17 
 
 
270 aa  218  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.1 
 
 
262 aa  218  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
269 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.36 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.39 
 
 
287 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.02 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.58 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.86 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.09 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.74 
 
 
273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.03 
 
 
256 aa  211  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.62 
 
 
297 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.83 
 
 
262 aa  209  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
261 aa  208  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.59 
 
 
264 aa  208  8e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.91 
 
 
273 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.8 
 
 
264 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.13 
 
 
263 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.56 
 
 
285 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.36 
 
 
285 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
285 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.36 
 
 
285 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.25 
 
 
262 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
260 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.91 
 
 
271 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
260 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.22 
 
 
263 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.83 
 
 
275 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
266 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.22 
 
 
263 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.48 
 
 
260 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  49.61 
 
 
355 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.47 
 
 
293 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
263 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
265 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.47 
 
 
293 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
268 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
268 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.23 
 
 
262 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.94 
 
 
267 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.37 
 
 
259 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.29 
 
 
258 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.65 
 
 
264 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.04 
 
 
271 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  47.04 
 
 
288 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 
295 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.67 
 
 
264 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.23 
 
 
272 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
265 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.23 
 
 
272 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.23 
 
 
272 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.27 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.53 
 
 
270 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.59 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.74 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.99 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.83 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.67 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.15 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 
272 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.25 
 
 
272 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.8 
 
 
273 aa  199  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.37 
 
 
270 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.11 
 
 
273 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
270 aa  198  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 
269 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.18 
 
 
272 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.94 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.87 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.98 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.53 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.24 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.58 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.51 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.8 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.84 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.87 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>