More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3067 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  90.81 
 
 
272 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  89.34 
 
 
272 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  86.76 
 
 
282 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.31 
 
 
272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.68 
 
 
272 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  75 
 
 
271 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  76.49 
 
 
269 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.01 
 
 
269 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.13 
 
 
269 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.16 
 
 
267 aa  363  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.28 
 
 
269 aa  358  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.27 
 
 
286 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  69.2 
 
 
270 aa  345  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.58 
 
 
268 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.34 
 
 
269 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.54 
 
 
270 aa  332  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.05 
 
 
275 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.02 
 
 
271 aa  325  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.04 
 
 
274 aa  324  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.3 
 
 
274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.67 
 
 
274 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.79 
 
 
270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.44 
 
 
268 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.47 
 
 
268 aa  301  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  65.78 
 
 
287 aa  299  4e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.78 
 
 
268 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.62 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.98 
 
 
268 aa  261  8e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.43 
 
 
273 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.57 
 
 
260 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.13 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
257 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.14 
 
 
263 aa  203  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  50.23 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 
269 aa  195  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 
263 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
295 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.13 
 
 
260 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.22 
 
 
273 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
296 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.57 
 
 
259 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.4 
 
 
258 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.27 
 
 
259 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
295 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.22 
 
 
285 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.98 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.41 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.26 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.22 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.3 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.43 
 
 
285 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.46 
 
 
293 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
268 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.46 
 
 
266 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.78 
 
 
260 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.6 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.98 
 
 
259 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.95 
 
 
287 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  38.95 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.78 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.87 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.16 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.59 
 
 
297 aa  178  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.76 
 
 
273 aa  178  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
272 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.54 
 
 
271 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.31 
 
 
269 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.22 
 
 
266 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
266 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
258 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.43 
 
 
285 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
264 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.22 
 
 
271 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
258 aa  175  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.16 
 
 
259 aa  175  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
265 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.64 
 
 
276 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
266 aa  175  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39 
 
 
258 aa  175  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.84 
 
 
258 aa  175  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.37 
 
 
265 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.46 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.96 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  38.67 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.3 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.47 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.93 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.78 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>