More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1306 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.23 
 
 
261 aa  378  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.34 
 
 
263 aa  377  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.22 
 
 
258 aa  344  6e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.22 
 
 
258 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.83 
 
 
258 aa  341  7e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.75 
 
 
261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.85 
 
 
258 aa  295  7e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.04 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.92 
 
 
266 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  47.1 
 
 
259 aa  218  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.95 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.99 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.95 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.87 
 
 
266 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.31 
 
 
273 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 
265 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.65 
 
 
266 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
264 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.75 
 
 
265 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
264 aa  208  8e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.38 
 
 
265 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.63 
 
 
265 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.7 
 
 
259 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.89 
 
 
271 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.38 
 
 
265 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
266 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.87 
 
 
268 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 
263 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.49 
 
 
260 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.96 
 
 
264 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.45 
 
 
262 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.94 
 
 
263 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.05 
 
 
270 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.52 
 
 
267 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
260 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
271 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.86 
 
 
271 aa  201  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.89 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.83 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 
258 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.31 
 
 
285 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.31 
 
 
268 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.58 
 
 
270 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.19 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
259 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.8 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.26 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
294 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
281 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.11 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.85 
 
 
272 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.91 
 
 
260 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
271 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
268 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.89 
 
 
270 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.61 
 
 
262 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.37 
 
 
287 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.29 
 
 
271 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
264 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
295 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.85 
 
 
263 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
266 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.34 
 
 
257 aa  193  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.19 
 
 
268 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.22 
 
 
264 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
272 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.79 
 
 
266 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.79 
 
 
263 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
268 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.76 
 
 
268 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
263 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
264 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.53 
 
 
269 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.83 
 
 
288 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.17 
 
 
272 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.34 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.9 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.21 
 
 
271 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.99 
 
 
268 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.76 
 
 
262 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.37 
 
 
259 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.42 
 
 
269 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.7 
 
 
265 aa  188  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
274 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 
269 aa  188  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
258 aa  188  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.18 
 
 
264 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.49 
 
 
267 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
267 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.27 
 
 
273 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>