More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0870 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 295 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  79.25 
 
 		 294 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  77.74 
 
 		 301 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.07 
 
 		 295 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.99 
 
 		 295 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17161  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.64 
 
 		 295 aa  361  6e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.14 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.79 
 
 		 293 aa  352  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.29 
 
 		 296 aa  340  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.36 
 
 		 295 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.74 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.38 
 
 		 295 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.06 
 
 		 295 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.95 
 
 		 297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.38 
 
 		 295 aa  324  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.61 
 
 		 294 aa  321  9.000000000000001e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.36 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.09 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  48.88 
 
 		 355 aa  281  7.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.87 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4892  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 		 280 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3804  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.11 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.743841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.94 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.93 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.32 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.5 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.86 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.08 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.94 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.2 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.2 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.11 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.86 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.11 
 
 		 268 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.04 
 
 		 268 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.89 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.07 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.48 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.68 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.37 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.74 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.55 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.55 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.22 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.04 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.3 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.79 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.31 
 
 		 264 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.32 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.89 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.22 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.11 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.33 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.43 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.3 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.47 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.22 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.04 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.21 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.39 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  45.15 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 		 266 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.52 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.6 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.79 
 
 		 278 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.92 
 
 		 267 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.61 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.48 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.97 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.84 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.22 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.73 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.97 
 
 		 279 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.47 
 
 		 266 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.21 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.79 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.890478  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.42 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.48 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.73 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.65 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.09 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 		 269 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.83 
 
 		 275 aa  202  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.06 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.85 
 
 		 265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>