More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4892 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4892  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3804  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.87 
 
 
291 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.743841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.79 
 
 
288 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.87 
 
 
293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.87 
 
 
293 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.01 
 
 
296 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.94 
 
 
295 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.58 
 
 
294 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.28 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.37 
 
 
302 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 
295 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.48 
 
 
294 aa  261  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.28 
 
 
295 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.34 
 
 
295 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  46.72 
 
 
355 aa  246  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.12 
 
 
301 aa  244  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 
295 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 
295 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.24 
 
 
265 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 
295 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.42 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17161  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.42 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.23 
 
 
268 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.04 
 
 
278 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
268 aa  201  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
285 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.74 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.96 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.18 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
276 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 
266 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.96 
 
 
273 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.61 
 
 
268 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
271 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.11 
 
 
295 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.7 
 
 
259 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.36 
 
 
285 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
262 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.08 
 
 
265 aa  192  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.27 
 
 
267 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
265 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
285 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.07 
 
 
266 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.28 
 
 
266 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  41.92 
 
 
288 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
262 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
266 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.22 
 
 
285 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
265 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.05 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.7 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2175  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  40.23 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.750011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.29 
 
 
270 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.59 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1935  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  39.1 
 
 
461 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.26 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
260 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
270 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
264 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
266 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
271 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
263 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
266 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.63 
 
 
263 aa  178  9e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
269 aa  178  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  39.77 
 
 
268 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
265 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.25 
 
 
266 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  41.35 
 
 
259 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.15 
 
 
267 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  40 
 
 
267 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.35 
 
 
287 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
258 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.88 
 
 
265 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.49 
 
 
278 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2004  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  39.1 
 
 
455 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.49479  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
265 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.2 
 
 
264 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3219  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.35 
 
 
264 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.49 
 
 
278 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2670  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  38.95 
 
 
453 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.64 
 
 
266 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2303  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  39.39 
 
 
455 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.43 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.42 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.11 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.39 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.04 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.39 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.02 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.04 
 
 
278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.38 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>