More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0159 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.02 
 
 
270 aa  267  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 
271 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.47 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.58 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.53 
 
 
271 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.47 
 
 
295 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.25 
 
 
285 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 
268 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 
265 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
266 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.76 
 
 
269 aa  254  8e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  50.38 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.39 
 
 
265 aa  252  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.96 
 
 
263 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 
266 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.87 
 
 
276 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 
264 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.11 
 
 
263 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 
270 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 
264 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
278 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.16 
 
 
278 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.5 
 
 
267 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.64 
 
 
277 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.35 
 
 
278 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.64 
 
 
277 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.55 
 
 
278 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.61 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.04 
 
 
269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.05 
 
 
265 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.03 
 
 
278 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
266 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.59 
 
 
265 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.4 
 
 
265 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.62 
 
 
263 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 
263 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.29 
 
 
265 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
285 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 
263 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.84 
 
 
268 aa  238  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.76 
 
 
270 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.97 
 
 
279 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.57 
 
 
270 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 
285 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.66 
 
 
268 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.64 
 
 
277 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.81 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.79 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.56 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
278 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.56 
 
 
267 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.55 
 
 
272 aa  232  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.67 
 
 
262 aa  232  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.99 
 
 
266 aa  231  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 
271 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.98 
 
 
267 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.67 
 
 
272 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.83 
 
 
268 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.73 
 
 
266 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.39 
 
 
262 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.61 
 
 
266 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.67 
 
 
271 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.53 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
267 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.97 
 
 
266 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.25 
 
 
266 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.01 
 
 
266 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.85 
 
 
271 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.29 
 
 
281 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  49.15 
 
 
268 aa  222  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.41 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.09 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.76 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.63 
 
 
261 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
266 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.97 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.75 
 
 
267 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.75 
 
 
272 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.36 
 
 
266 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.84 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3219  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.09 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.22 
 
 
266 aa  215  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.79 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  48.39 
 
 
259 aa  215  8e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.21 
 
 
268 aa  215  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.19 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.49 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.62 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>