More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3582 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 263 aa  501  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.9 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.15 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.47 
 
 		 264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.61 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.08 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 		 265 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.98 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.23 
 
 		 285 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.2 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.79 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.11 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.11 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.91 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  50 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.56 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.62 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.8 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.4 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 		 286 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.58 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.88 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 		 271 aa  211  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.79 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 		 271 aa  210  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.48 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.54 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  49.8 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.33 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  50 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.67 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.54 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.39 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.33 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.16 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.83 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.49 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.29 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.31 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.95 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.19 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.46 
 
 		 262 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.1 
 
 		 266 aa  208  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.39 
 
 		 273 aa  208  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.36 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.4 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.69 
 
 		 275 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.39 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.51 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.02 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.37 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.61 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.89 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.39 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.08 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.53 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.25 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.05 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.04 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.9 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.79 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.39 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.25 
 
 		 277 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 		 272 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 		 272 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 		 272 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.34 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.79 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.17 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.93 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.77 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>