More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2948 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  530  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  80.15 
 
 
272 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  79.41 
 
 
272 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.31 
 
 
272 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.31 
 
 
272 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.31 
 
 
272 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  77.94 
 
 
282 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  77.94 
 
 
272 aa  400  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.51 
 
 
271 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.52 
 
 
269 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.01 
 
 
269 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.03 
 
 
269 aa  352  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.42 
 
 
267 aa  346  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.55 
 
 
269 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.79 
 
 
286 aa  338  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.52 
 
 
268 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.36 
 
 
271 aa  316  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.16 
 
 
269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.22 
 
 
270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.36 
 
 
275 aa  308  5e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.98 
 
 
270 aa  308  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.21 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.84 
 
 
274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.19 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.82 
 
 
274 aa  301  8.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.74 
 
 
270 aa  300  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  63.12 
 
 
287 aa  296  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.4 
 
 
268 aa  292  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.74 
 
 
268 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.89 
 
 
268 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  60.55 
 
 
268 aa  271  8.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.23 
 
 
273 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 
273 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.09 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.98 
 
 
272 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.33 
 
 
277 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.86 
 
 
269 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.89 
 
 
263 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.63 
 
 
259 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.34 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.57 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
257 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
263 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
273 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.87 
 
 
287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.07 
 
 
272 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
259 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
273 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.58 
 
 
258 aa  186  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 
259 aa  185  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.14 
 
 
275 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.22 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.91 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.08 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.97 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
285 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.47 
 
 
271 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 
265 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
269 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.51 
 
 
257 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  41 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.45 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.54 
 
 
295 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
260 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
285 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.63 
 
 
267 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
285 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.61 
 
 
262 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.36 
 
 
277 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.98 
 
 
266 aa  175  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.41 
 
 
260 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
268 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.36 
 
 
277 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
266 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.3 
 
 
266 aa  175  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.62 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.37 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.77 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.36 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.03 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.6 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.47 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.8 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.44 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.91 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.08 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.36 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.27 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2155  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.18 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.209706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.35 
 
 
288 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  38.58 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.02 
 
 
260 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  171  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>