More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06390 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  100 
 
 		 260 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.42 
 
 		 259 aa  315  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  56.68 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.94 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3793  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.24 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.81 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4168  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.12 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000324578  decreased coverage  0.0000000000679641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.4 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.5 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.55 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.55 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.11 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.34 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.29 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.13 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.13 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.13 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4050  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.76 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1294  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.31 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.52 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.62 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.63 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.449092  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.46 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1319  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000247169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.39 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.23 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.11 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.33 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1396  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.64 
 
 		 270 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.4 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 		 271 aa  185  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.77 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.93 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.58 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1133  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.15 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 		 269 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.69 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.5 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.25 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.24 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.34 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.7 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1147  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.3 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.65 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.56 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.6 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.05 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.32 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.74 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.31 
 
 		 275 aa  181  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.41 
 
 		 275 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.98 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.4 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.96 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.39 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.35 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.91 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.22 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.19 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.31 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.05 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.74 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.96 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.27 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.34 
 
 		 266 aa  178  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.08 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.51 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.53 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.94 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.7 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.8 
 
 		 266 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.74 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.61 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.61 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.26 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1359  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.53 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.68 
 
 		 294 aa  175  8e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.95 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>