More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1825 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
266 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  51.94 
 
 
261 aa  271  9e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.11 
 
 
269 aa  261  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.28 
 
 
259 aa  259  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.94 
 
 
260 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3793  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.14 
 
 
272 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4168  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.88 
 
 
263 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000324578  decreased coverage  0.0000000000679641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.7 
 
 
278 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 
279 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
271 aa  198  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.93 
 
 
271 aa  198  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.29 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.29 
 
 
266 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.91 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
277 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
277 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.31 
 
 
278 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.68 
 
 
273 aa  195  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.75 
 
 
266 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
271 aa  192  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 
262 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
264 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.87 
 
 
267 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
264 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
266 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.95 
 
 
264 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.78 
 
 
267 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
272 aa  188  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.13 
 
 
266 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.26 
 
 
263 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
277 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
264 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
264 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.25 
 
 
265 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.33 
 
 
295 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.67 
 
 
265 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
267 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
271 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.94 
 
 
278 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
270 aa  185  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
261 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.44 
 
 
270 aa  184  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.68 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.46 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.27 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.62 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.86 
 
 
273 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
270 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.06 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.16 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.64 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.23 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.98 
 
 
265 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.46 
 
 
258 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.54 
 
 
295 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
267 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.22 
 
 
266 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
267 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
285 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
265 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  40.4 
 
 
288 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
285 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.17 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.22 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
269 aa  178  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 
263 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 
258 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.33 
 
 
295 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
295 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.05 
 
 
261 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 
267 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
257 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.55 
 
 
268 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
261 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.43 
 
 
275 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
261 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.57 
 
 
271 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1443  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.63 
 
 
295 aa  175  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.810635  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.06 
 
 
270 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.15 
 
 
260 aa  175  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.96 
 
 
266 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  39.39 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.84 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.08 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.68 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.41 
 
 
261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.69 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>