More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4168 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4168  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
263 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000324578  decreased coverage  0.0000000000679641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.85 
 
 
259 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.23 
 
 
269 aa  278  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  52.51 
 
 
261 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.88 
 
 
266 aa  265  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3793  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.72 
 
 
272 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.12 
 
 
260 aa  258  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.88 
 
 
265 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.71 
 
 
264 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
269 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
271 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.58 
 
 
266 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
268 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.57 
 
 
278 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.75 
 
 
264 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
265 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.63 
 
 
267 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.02 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.7 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.25 
 
 
265 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.02 
 
 
270 aa  198  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 
278 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
267 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
261 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 
279 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.86 
 
 
278 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 
277 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
258 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 
277 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 
277 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.94 
 
 
262 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  42.97 
 
 
268 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41 
 
 
266 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.35 
 
 
264 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.73 
 
 
271 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.3 
 
 
267 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.46 
 
 
258 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
267 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
273 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.61 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
270 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.86 
 
 
295 aa  188  8e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
266 aa  188  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
272 aa  188  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.78 
 
 
265 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.33 
 
 
267 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.28 
 
 
268 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 
277 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1443  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.64 
 
 
295 aa  185  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.810635  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.5 
 
 
267 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.47 
 
 
260 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
266 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
266 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.83 
 
 
262 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.31 
 
 
265 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.48 
 
 
271 aa  181  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.84 
 
 
258 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
266 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
261 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.22 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.41 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.7 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.8 
 
 
261 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
266 aa  178  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.87 
 
 
295 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
267 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.05 
 
 
267 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
269 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.37 
 
 
266 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
285 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.6 
 
 
261 aa  176  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
261 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
295 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.32 
 
 
265 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
285 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
285 aa  175  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.35 
 
 
265 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
264 aa  174  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.38 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.57 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.883215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>