More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5475 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
269 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3793  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.46 
 
 
272 aa  295  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  51.54 
 
 
261 aa  265  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.11 
 
 
266 aa  261  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4168  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.23 
 
 
263 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000324578  decreased coverage  0.0000000000679641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.81 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 
259 aa  239  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.98 
 
 
271 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
265 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.35 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.96 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.96 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  45 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.24 
 
 
265 aa  198  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
269 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.23 
 
 
264 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.15 
 
 
274 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
264 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
276 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.37 
 
 
267 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
266 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 
263 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.79 
 
 
271 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
270 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
273 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.94 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
272 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.17 
 
 
267 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.26 
 
 
266 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.75 
 
 
268 aa  185  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.7 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.51 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  42.4 
 
 
268 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
261 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.4 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.8 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.81 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.38 
 
 
261 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.78 
 
 
267 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 
266 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.29 
 
 
267 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.91 
 
 
261 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
266 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.53 
 
 
278 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.77 
 
 
261 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.890478  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
285 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
261 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.7 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.31 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  41.2 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.07 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
278 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
295 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.98 
 
 
270 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
270 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3618  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
261 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.08 
 
 
271 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
265 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
270 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
264 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.6 
 
 
266 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.31 
 
 
270 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
261 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
261 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.883215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.42 
 
 
278 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.17 
 
 
277 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
261 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.42 
 
 
278 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1097  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
271 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.7 
 
 
267 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
295 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.48 
 
 
270 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.85 
 
 
262 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.75 
 
 
271 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
269 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
267 aa  175  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
285 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
285 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.7 
 
 
261 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.72 
 
 
267 aa  175  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.26 
 
 
271 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.12 
 
 
267 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.26 
 
 
260 aa  175  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.75 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.69 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.32 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>