More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1097 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1097  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
271 aa  523  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
269 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.93 
 
 
260 aa  175  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.33 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  42.15 
 
 
261 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 
266 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3793  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.74 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
259 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.54 
 
 
273 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.98 
 
 
267 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1198  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.59 
 
 
255 aa  157  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.2 
 
 
275 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.25 
 
 
260 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1431  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.25 
 
 
260 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
269 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.47 
 
 
263 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.15 
 
 
273 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.21 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.85 
 
 
266 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.82 
 
 
271 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.26 
 
 
266 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.26 
 
 
266 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.93 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.92 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.44 
 
 
259 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
271 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0940  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.68 
 
 
262 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
269 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.25 
 
 
268 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
274 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
270 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.57 
 
 
259 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
274 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.32 
 
 
262 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3554  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.61 
 
 
266 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.73 
 
 
317 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
265 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.01 
 
 
272 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.13 
 
 
265 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.01 
 
 
272 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  35.25 
 
 
259 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.01 
 
 
272 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.17 
 
 
270 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.99 
 
 
274 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.52 
 
 
269 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.85 
 
 
269 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.04 
 
 
258 aa  141  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.36 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.83 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.5 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.82 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.32 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.56 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.35 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.82 
 
 
261 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.79 
 
 
272 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.28 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.08 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.95 
 
 
295 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.56 
 
 
265 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
272 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1396  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.44 
 
 
253 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.8 
 
 
287 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.08 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.43 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.17 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.02 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1133  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.03 
 
 
253 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4168  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.67 
 
 
263 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000324578  decreased coverage  0.0000000000679641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.41 
 
 
272 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.13 
 
 
265 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.63 
 
 
253 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.63 
 
 
253 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.63 
 
 
253 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.449092  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.95 
 
 
295 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.52 
 
 
270 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.78 
 
 
286 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1319  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.63 
 
 
253 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000247169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
267 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1294  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.03 
 
 
253 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1552  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.27 
 
 
264 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.78 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.98 
 
 
258 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1551  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.68 
 
 
255 aa  136  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.15 
 
 
295 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.29 
 
 
260 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  34.35 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.98 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.17 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.05 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.82 
 
 
282 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.98 
 
 
258 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.74 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.9 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.57 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.31 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.75 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.36 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>