More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1198 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1198  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
255 aa  501  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.3 
 
 
260 aa  178  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
266 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
266 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
266 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.23 
 
 
268 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.08 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.46 
 
 
260 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
267 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.78 
 
 
265 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.38 
 
 
266 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.56 
 
 
273 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0225  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 
251 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  40.23 
 
 
261 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.1 
 
 
265 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.16 
 
 
263 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.75 
 
 
260 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2175  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  44.66 
 
 
461 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.750011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.26 
 
 
278 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.76 
 
 
271 aa  158  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1210  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
253 aa  158  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.79 
 
 
259 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.44 
 
 
266 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.57 
 
 
268 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
259 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.15 
 
 
268 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
267 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.74 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
295 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1551  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.12 
 
 
255 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.19 
 
 
281 aa  155  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.84 
 
 
278 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.55 
 
 
262 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.74 
 
 
265 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.47 
 
 
268 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.53 
 
 
295 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.45 
 
 
259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.27 
 
 
273 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.22 
 
 
271 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.27 
 
 
266 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.32 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
295 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.4 
 
 
272 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1151  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  41.05 
 
 
470 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.28 
 
 
261 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1935  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  38.27 
 
 
461 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.1 
 
 
265 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.97 
 
 
267 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.48 
 
 
270 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2303  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  39.91 
 
 
455 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
263 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2815  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.28 
 
 
257 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.51 
 
 
278 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.26 
 
 
295 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.69 
 
 
278 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1788  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.22 
 
 
252 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.96 
 
 
274 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  38.8 
 
 
268 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.41 
 
 
259 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1097  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.2 
 
 
271 aa  149  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  34.8 
 
 
271 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.74 
 
 
258 aa  149  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.38 
 
 
263 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.71 
 
 
272 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.12 
 
 
278 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.17 
 
 
272 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0793  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  40.3 
 
 
469 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.685863  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
259 aa  148  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.64 
 
 
258 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.75 
 
 
276 aa  148  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.76 
 
 
267 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.4 
 
 
262 aa  148  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.59 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.37 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2832  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  42.38 
 
 
468 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.39 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  34.62 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01236  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  37.72 
 
 
452 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1870  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  37.72 
 
 
453 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000113165 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.71 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.17 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2670  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  36.29 
 
 
453 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.29 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  39.74 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.31 
 
 
293 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.98 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.29 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01246  hypothetical protein  37.72 
 
 
452 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1894  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  38.16 
 
 
452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.890724  hitchhiker  0.00124685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.29 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.09 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1461  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  37.72 
 
 
452 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00841012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.5 
 
 
267 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.95 
 
 
269 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.31 
 
 
293 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.56 
 
 
264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>