More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0225 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0225  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.58 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0216  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.39 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1788  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.98 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1396  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.94 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000419761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.47 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1198  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.54 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.78 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2155  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.209706 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.27 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.48 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.87 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1693  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.84 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.24 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.8 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.99 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.81 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.18 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.59 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.51 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1631  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0107  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.15 
 
 		 271 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.94 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.88 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.94 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4050  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.08 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.55 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.66 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.48 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.15 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0250  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.68 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.24 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.84 
 
 		 263 aa  148  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1651  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.68 
 
 		 229 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.885252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.39 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.21 
 
 		 267 aa  148  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.48 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1115  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.35 
 
 		 228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.79 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.29 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.92 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.11 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.5 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.24 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.58 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.24 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.449092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1319  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.24 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000247169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.75 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  39.7 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0333  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.39 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.7 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.74 
 
 		 229 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.58 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.24 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1133  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.24 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.81 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1396  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.4 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  43.3 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.54 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.83 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.51 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.11 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1210  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.01 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1294  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.82 
 
 		 253 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1147  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.82 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.08 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.58 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.15 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.82 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.49 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.44 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.79 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.91 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.85 
 
 		 259 aa  141  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.63 
 
 		 271 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.91 
 
 		 267 aa  141  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.15 
 
 		 272 aa  141  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.09 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.12 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.15 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.34 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.23 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.51 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.8 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.51 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.2 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1057  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  40.4 
 
 		 469 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>