More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1322 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  9e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
258 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
262 aa  225  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.71 
 
 
261 aa  222  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.41 
 
 
263 aa  216  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.11 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.74 
 
 
261 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.61 
 
 
266 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.07 
 
 
266 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.46 
 
 
259 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
275 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.35 
 
 
266 aa  201  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.92 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
259 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.98 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.38 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
262 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
264 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
258 aa  194  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
265 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
273 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.17 
 
 
259 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
270 aa  191  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
267 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
269 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.37 
 
 
258 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.64 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.33 
 
 
271 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.44 
 
 
266 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
263 aa  188  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
258 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.48 
 
 
267 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.13 
 
 
264 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 
260 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.41 
 
 
259 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.46 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.53 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.26 
 
 
268 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
266 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02761  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  41.54 
 
 
479 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
256 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
267 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.23 
 
 
265 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.6 
 
 
263 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2175  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  41.31 
 
 
461 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.750011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.16 
 
 
273 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
259 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
263 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.87 
 
 
274 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.77 
 
 
265 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.83 
 
 
260 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.83 
 
 
271 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.55 
 
 
271 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2315  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  44.14 
 
 
475 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2045  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  44.14 
 
 
475 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1935  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  44.14 
 
 
475 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
264 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1443  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.71 
 
 
295 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.810635  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003085  indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  40.77 
 
 
479 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1935  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  41.15 
 
 
461 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.49 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.39 
 
 
266 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.14 
 
 
273 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.25 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  40.38 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1198  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.3 
 
 
255 aa  178  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.02 
 
 
263 aa  178  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 
271 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.93 
 
 
278 aa  178  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2303  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  45.05 
 
 
455 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1396  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.24 
 
 
255 aa  178  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000419761  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
259 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.89 
 
 
260 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.4 
 
 
268 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0972  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.35 
 
 
295 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0625628  hitchhiker  0.000581353 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.4 
 
 
268 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46 
 
 
258 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.78 
 
 
272 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.46 
 
 
257 aa  176  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1870  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  40.54 
 
 
453 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000113165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.26 
 
 
285 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
270 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2004  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  45.5 
 
 
455 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.49479  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
251 aa  175  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.16 
 
 
268 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2670  bifunctional indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase  40.46 
 
 
453 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  38.64 
 
 
288 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>