More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1552 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1552  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1551  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.1 
 
 
255 aa  316  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1147  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
253 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4050  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.3 
 
 
253 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
253 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
253 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1133  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.85 
 
 
253 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
253 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.449092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1319  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
253 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000247169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1294  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.3 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1396  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.46 
 
 
253 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0114695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1359  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 
253 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0940  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
262 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.89 
 
 
265 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.57 
 
 
258 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.37 
 
 
256 aa  171  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
267 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.38 
 
 
271 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.4 
 
 
259 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
260 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1431  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
260 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.29 
 
 
263 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.95 
 
 
259 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.59 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.86 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.9 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.44 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.76 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.36 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.14 
 
 
267 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.21 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.89 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.36 
 
 
265 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.5 
 
 
260 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.45 
 
 
267 aa  161  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.41 
 
 
267 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.87 
 
 
258 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.54 
 
 
262 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.93 
 
 
267 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.81 
 
 
259 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
262 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.7 
 
 
270 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.76 
 
 
265 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.34 
 
 
268 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.01 
 
 
268 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.15 
 
 
257 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.87 
 
 
263 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.91 
 
 
278 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.74 
 
 
276 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.23 
 
 
270 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  39.35 
 
 
288 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.16 
 
 
270 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 
263 aa  158  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3554  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.34 
 
 
266 aa  158  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43 
 
 
267 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.67 
 
 
262 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.6 
 
 
266 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.22 
 
 
267 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.76 
 
 
270 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.52 
 
 
257 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.79 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.39 
 
 
273 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.07 
 
 
266 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.33 
 
 
266 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.89 
 
 
266 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.55 
 
 
266 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.72 
 
 
275 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
260 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.02 
 
 
271 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.19 
 
 
266 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.68 
 
 
278 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.6 
 
 
267 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
269 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 
264 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.02 
 
 
267 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.5 
 
 
265 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  43.96 
 
 
261 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.57 
 
 
268 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.02 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.55 
 
 
251 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.25 
 
 
264 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.65 
 
 
266 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.55 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.51 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.29 
 
 
278 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.55 
 
 
264 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
261 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 
274 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
278 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
272 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.26 
 
 
271 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.73 
 
 
285 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.5 
 
 
270 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.68 
 
 
261 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.57 
 
 
266 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.5 
 
 
285 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.45 
 
 
260 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>