More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0074 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
251 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0225  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.58 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1788  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.75 
 
 
252 aa  245  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0216  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.78 
 
 
267 aa  239  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1396  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.64 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000419761  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.64 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.17 
 
 
271 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
262 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
261 aa  175  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.02 
 
 
260 aa  175  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.36 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.77 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.46 
 
 
263 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.23 
 
 
258 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.23 
 
 
258 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 
263 aa  170  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.11 
 
 
265 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
295 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
258 aa  168  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.98 
 
 
270 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.23 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.89 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
264 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0914  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.87 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.44 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.22 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.22 
 
 
264 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1271  Indole-3-glycerol phosphate synthase  49.29 
 
 
269 aa  162  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.98 
 
 
269 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.02 
 
 
267 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.82 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.19 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
264 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.16 
 
 
294 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.54 
 
 
287 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.97 
 
 
266 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.98 
 
 
267 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
267 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.82 
 
 
270 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.22 
 
 
260 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2155  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.11 
 
 
260 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.209706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.95 
 
 
266 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.92 
 
 
270 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.73 
 
 
266 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1631  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.52 
 
 
259 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.93 
 
 
277 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.25 
 
 
288 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.93 
 
 
277 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.47 
 
 
268 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 
266 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.93 
 
 
277 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  43.59 
 
 
268 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.32 
 
 
258 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.02 
 
 
267 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 
296 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
278 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
295 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.39 
 
 
278 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.39 
 
 
265 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
274 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.7 
 
 
272 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.68 
 
 
267 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.65 
 
 
261 aa  156  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.53 
 
 
295 aa  155  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0250  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.95 
 
 
229 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
262 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.15 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.13 
 
 
266 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
277 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.87 
 
 
278 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.75 
 
 
266 aa  154  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.07 
 
 
275 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.89 
 
 
271 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
265 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.98 
 
 
271 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.68 
 
 
259 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.81 
 
 
266 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.98 
 
 
270 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.23 
 
 
266 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.66 
 
 
258 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.39 
 
 
278 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.14 
 
 
262 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.41 
 
 
278 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.71 
 
 
278 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.69 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.75 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.95 
 
 
279 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.22 
 
 
294 aa  152  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.29 
 
 
266 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1552  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.55 
 
 
264 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.53 
 
 
262 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.36 
 
 
260 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>