More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3175 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
268 aa  518  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.84 
 
 
268 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.48 
 
 
274 aa  355  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  76.98 
 
 
268 aa  352  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.81 
 
 
274 aa  346  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.45 
 
 
269 aa  339  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.55 
 
 
268 aa  332  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.05 
 
 
269 aa  332  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  70.57 
 
 
287 aa  332  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.52 
 
 
274 aa  331  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.58 
 
 
267 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.55 
 
 
317 aa  326  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.29 
 
 
270 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.78 
 
 
272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.16 
 
 
272 aa  322  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.47 
 
 
286 aa  321  7e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.78 
 
 
272 aa  321  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.78 
 
 
272 aa  321  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.78 
 
 
272 aa  321  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  64.29 
 
 
270 aa  318  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.3 
 
 
272 aa  318  9e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.91 
 
 
275 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.16 
 
 
271 aa  314  8e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.39 
 
 
271 aa  314  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.54 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.74 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.77 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.17 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.74 
 
 
269 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.9 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  56.42 
 
 
268 aa  252  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.62 
 
 
273 aa  244  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.85 
 
 
272 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.62 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.16 
 
 
258 aa  205  7e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.68 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
258 aa  195  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.9 
 
 
257 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.56 
 
 
259 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
294 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.23 
 
 
296 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 
263 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.44 
 
 
259 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
268 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.62 
 
 
260 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
273 aa  185  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.38 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.25 
 
 
257 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.63 
 
 
265 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.24 
 
 
269 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.19 
 
 
266 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 
270 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.01 
 
 
277 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.54 
 
 
295 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.69 
 
 
264 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.28 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.13 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.17 
 
 
263 aa  178  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
258 aa  178  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.91 
 
 
259 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.64 
 
 
260 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.25 
 
 
268 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
271 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
266 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.17 
 
 
278 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
263 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.77 
 
 
263 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.86 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.39 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.47 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1693  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.29 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.78 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.39 
 
 
259 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.76 
 
 
276 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.53 
 
 
266 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.39 
 
 
259 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
293 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.22 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4370  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
270 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.55 
 
 
267 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.88 
 
 
288 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.25 
 
 
265 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.18 
 
 
285 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
264 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.13 
 
 
285 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
264 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>