More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4370 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4370  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
268 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.39 
 
 
266 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
271 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
263 aa  188  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
264 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.09 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.47 
 
 
267 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.47 
 
 
265 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.68 
 
 
273 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.98 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.64 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 
264 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.74 
 
 
260 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.43 
 
 
266 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.5 
 
 
267 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.4 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.11 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.04 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.4 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.04 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
269 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
271 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
264 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
268 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
278 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.43 
 
 
259 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
263 aa  170  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.63 
 
 
274 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.13 
 
 
268 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.23 
 
 
271 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.83 
 
 
270 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
275 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.77 
 
 
269 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
263 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.29 
 
 
265 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
269 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.78 
 
 
264 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
260 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.7 
 
 
266 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.72 
 
 
272 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
268 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.47 
 
 
270 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.33 
 
 
267 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 
266 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.39 
 
 
267 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
295 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 
262 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.31 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.87 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.79 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  41.22 
 
 
259 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
295 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.15 
 
 
268 aa  165  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.6 
 
 
271 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.89 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.8 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.46 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.1 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.06 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.26 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.64 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.35 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.64 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.64 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.54 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.76 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.6 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.38 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.98 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.93 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.7 
 
 
266 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.5 
 
 
260 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.84 
 
 
282 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.66 
 
 
262 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.32 
 
 
272 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.25 
 
 
285 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.67 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1825  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.1 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.55 
 
 
270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.22 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.62 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.11 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.98 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.82 
 
 
276 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.4 
 
 
270 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.23 
 
 
266 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.21 
 
 
277 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 
261 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>