More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1252 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
269 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  85.77 
 
 
269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.16 
 
 
273 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.89 
 
 
272 aa  291  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.33 
 
 
259 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.33 
 
 
259 aa  238  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.69 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.85 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 
296 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  49.81 
 
 
259 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 
260 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.88 
 
 
264 aa  224  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.88 
 
 
264 aa  224  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.01 
 
 
295 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.39 
 
 
273 aa  221  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.26 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.21 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.58 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.44 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.95 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.72 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.72 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.23 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.07 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.62 
 
 
285 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.93 
 
 
295 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.68 
 
 
267 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.78 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.85 
 
 
294 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.39 
 
 
266 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.63 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
278 aa  215  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.42 
 
 
268 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.04 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.04 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.41 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.27 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.69 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.88 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.6 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.91 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.47 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.47 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 
276 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.51 
 
 
268 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.57 
 
 
266 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 
272 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.01 
 
 
266 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.55 
 
 
265 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.31 
 
 
261 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.52 
 
 
266 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.89 
 
 
265 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.39 
 
 
264 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.11 
 
 
266 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.69 
 
 
267 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.86 
 
 
264 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
266 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.5 
 
 
259 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.93 
 
 
271 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.51 
 
 
264 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.56 
 
 
279 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.36 
 
 
265 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.87 
 
 
271 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.29 
 
 
272 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
268 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.38 
 
 
271 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.51 
 
 
262 aa  205  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.05 
 
 
267 aa  205  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.52 
 
 
278 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.67 
 
 
295 aa  204  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.86 
 
 
266 aa  204  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
285 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.08 
 
 
256 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
285 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.91 
 
 
257 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.82 
 
 
278 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.24 
 
 
263 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.12 
 
 
268 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.24 
 
 
269 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
266 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.67 
 
 
267 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.44 
 
 
278 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  43.68 
 
 
355 aa  202  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.49 
 
 
270 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.64 
 
 
261 aa  201  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.27 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.64 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.15 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.14 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.69 
 
 
262 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.64 
 
 
265 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.45 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.22 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>