More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1164 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  82.84 
 
 
268 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  83.77 
 
 
268 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.21 
 
 
274 aa  364  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.59 
 
 
274 aa  362  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  76.23 
 
 
269 aa  357  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.99 
 
 
272 aa  347  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.03 
 
 
267 aa  347  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.34 
 
 
269 aa  342  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.32 
 
 
275 aa  341  9e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.55 
 
 
270 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.44 
 
 
269 aa  339  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  73.21 
 
 
287 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.47 
 
 
272 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.82 
 
 
271 aa  337  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.47 
 
 
272 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.47 
 
 
272 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.42 
 
 
268 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.14 
 
 
286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  67.29 
 
 
270 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.7 
 
 
272 aa  334  7.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.78 
 
 
274 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.54 
 
 
271 aa  332  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.17 
 
 
317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.94 
 
 
282 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.32 
 
 
272 aa  321  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.06 
 
 
269 aa  321  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.42 
 
 
270 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.78 
 
 
269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.89 
 
 
272 aa  314  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  63.1 
 
 
260 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.31 
 
 
273 aa  261  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.59 
 
 
268 aa  260  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.09 
 
 
273 aa  251  7e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.56 
 
 
272 aa  247  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.63 
 
 
277 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.9 
 
 
262 aa  202  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  45.08 
 
 
259 aa  201  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.26 
 
 
258 aa  201  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.26 
 
 
258 aa  201  9e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.38 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.26 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.94 
 
 
258 aa  198  7e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.56 
 
 
269 aa  195  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.14 
 
 
257 aa  193  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.9 
 
 
263 aa  193  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
295 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
270 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.22 
 
 
273 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.02 
 
 
265 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.25 
 
 
261 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.21 
 
 
293 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.86 
 
 
273 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
272 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.41 
 
 
263 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 
263 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
293 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.11 
 
 
296 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.19 
 
 
288 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.48 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.28 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
271 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.22 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.89 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
266 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
266 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.32 
 
 
294 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.96 
 
 
295 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.68 
 
 
262 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.74 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.21 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
266 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.17 
 
 
260 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.82 
 
 
266 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
271 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00648  Anthranilate synthase component 2 (EC 4.1.3.27)(Anthranilate synthase component II) [Includes Glutamine amidotransferase;Indole-3-glycerol phosphate synthase(IGPS)(EC 4.1.1.48);N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase(PRAI)(EC 5.3.1.24)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P06531]  43.92 
 
 
664 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
268 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.85 
 
 
271 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.72 
 
 
285 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.19 
 
 
266 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.62 
 
 
258 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
264 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.13 
 
 
285 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.23 
 
 
297 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.72 
 
 
285 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.08 
 
 
265 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.85 
 
 
267 aa  175  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
268 aa  174  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.22 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.54 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.53 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.09 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.58 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>