More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3397 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
267 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  95.88 
 
 
286 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  76.78 
 
 
269 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  74.91 
 
 
269 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.16 
 
 
272 aa  363  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.16 
 
 
272 aa  363  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.16 
 
 
272 aa  363  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.79 
 
 
272 aa  362  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.41 
 
 
272 aa  360  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.66 
 
 
269 aa  358  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.29 
 
 
269 aa  354  7.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.79 
 
 
271 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.16 
 
 
282 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.8 
 
 
272 aa  352  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.42 
 
 
272 aa  333  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.94 
 
 
269 aa  331  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.7 
 
 
270 aa  331  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.65 
 
 
274 aa  325  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.67 
 
 
268 aa  323  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.41 
 
 
275 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  65.27 
 
 
270 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  67.82 
 
 
287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.03 
 
 
268 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.41 
 
 
268 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.54 
 
 
270 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.74 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.04 
 
 
274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.58 
 
 
268 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.13 
 
 
317 aa  305  7e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.16 
 
 
274 aa  292  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.61 
 
 
268 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.53 
 
 
273 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.54 
 
 
273 aa  256  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.8 
 
 
260 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.37 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.94 
 
 
259 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.05 
 
 
269 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.37 
 
 
258 aa  200  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.47 
 
 
277 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
263 aa  194  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.79 
 
 
270 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
258 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
260 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
258 aa  191  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.08 
 
 
258 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
257 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.45 
 
 
259 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.49 
 
 
262 aa  187  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
295 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
261 aa  186  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.33 
 
 
260 aa  186  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
293 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.4 
 
 
271 aa  184  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.06 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.51 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.33 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.81 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.72 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 
275 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 
285 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.53 
 
 
259 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.82 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.73 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.35 
 
 
265 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.64 
 
 
265 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.63 
 
 
257 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.16 
 
 
297 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
266 aa  174  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.32 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.72 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.19 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.45 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.55 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.31 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.34 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.31 
 
 
268 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4171  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.11 
 
 
260 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.29 
 
 
267 aa  172  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.55 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.3 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.5 
 
 
266 aa  171  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.95 
 
 
265 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.48 
 
 
294 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
295 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.46 
 
 
266 aa  171  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4198  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.22 
 
 
260 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00333421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.94 
 
 
288 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.68 
 
 
271 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.98 
 
 
267 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.91 
 
 
270 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.51 
 
 
260 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.55 
 
 
287 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.49 
 
 
258 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
258 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>