More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  100 
 
 
277 aa  524  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.1 
 
 
271 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.69 
 
 
273 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.66 
 
 
269 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.62 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.13 
 
 
272 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.13 
 
 
272 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.13 
 
 
272 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.23 
 
 
268 aa  251  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.96 
 
 
272 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.85 
 
 
275 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.84 
 
 
270 aa  247  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.63 
 
 
270 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.17 
 
 
272 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.33 
 
 
272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60 
 
 
270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.92 
 
 
273 aa  245  6e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.23 
 
 
269 aa  244  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.04 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.63 
 
 
282 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.17 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.13 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.87 
 
 
269 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.69 
 
 
271 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 
274 aa  234  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.68 
 
 
268 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.47 
 
 
267 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.22 
 
 
317 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.44 
 
 
269 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.66 
 
 
260 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.23 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.94 
 
 
274 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.63 
 
 
268 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.82 
 
 
287 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.78 
 
 
269 aa  204  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.63 
 
 
268 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.88 
 
 
259 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.06 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.85 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  45.1 
 
 
259 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.8 
 
 
265 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.05 
 
 
273 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.59 
 
 
270 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.24 
 
 
265 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.75 
 
 
271 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.25 
 
 
273 aa  188  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  40 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
296 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.67 
 
 
260 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.89 
 
 
273 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 
272 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.19 
 
 
266 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.4 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.6 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.01 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.92 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.27 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
264 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.58 
 
 
265 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.31 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.2 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.2 
 
 
258 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.2 
 
 
258 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.88 
 
 
278 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
295 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.58 
 
 
268 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.04 
 
 
258 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.88 
 
 
277 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.14 
 
 
259 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
278 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.88 
 
 
277 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.27 
 
 
270 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.97 
 
 
267 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.2 
 
 
263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.71 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.48 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.61 
 
 
259 aa  178  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.58 
 
 
287 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
259 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.32 
 
 
257 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.5 
 
 
277 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.24 
 
 
267 aa  175  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.28 
 
 
294 aa  175  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.37 
 
 
267 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
267 aa  175  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
302 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.17 
 
 
269 aa  175  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
266 aa  175  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.02 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.46 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.62 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.38 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.73 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.98 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.77 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.74 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
293 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>