More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1071 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1071  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 		 245 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.045266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1013  hypothetical protein  88.57 
 
 		 245 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18033  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  37.32 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5534  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.23 
 
 		 239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0533877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2026  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.06 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826373  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.63 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.79 
 
 		 313 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  32.29 
 
 		 317 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.29 
 
 		 317 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  37.19 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.23 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  34.78 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2425  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  38.21 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.58 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.64 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.69 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.57 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.21 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.65 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.9 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  34.62 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  28.1 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.43 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.81 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.68 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  31.9 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 317 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  28.91 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.33 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1959  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.56 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.35 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4003  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.12 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.97 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  32.46 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.7 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.98 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.12 
 
 		 221 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  30.48 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  30.48 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  34.45 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.71 
 
 		 320 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.11 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  30.48 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  26.29 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  25.48 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.87 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.54 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.33 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.9 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  31.1 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2064  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.81 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.69 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  30.28 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  24.15 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  31.6 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.07 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  26.69 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3338  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.43 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0343  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.92 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  26.69 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.59 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.38 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0463  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.47 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  normal  0.0170301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  30.05 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  30.05 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  24.04 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.72 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  32.06 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.14 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3902  hypothetical protein  34.6 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  31.77 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  35.68 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.06 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.47 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.6 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.5 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.75 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.26 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.2 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2974  DeoR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  0.781562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.06 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1998  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.65 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.21 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  30.1 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.25 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>