More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3671 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3671  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  788    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.254615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3812  Peptidase M23  86.95 
 
 
404 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3729  Peptidase M23  96.21 
 
 
413 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3799  peptidase M23B  61.44 
 
 
399 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  30.6 
 
 
690 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  29.12 
 
 
680 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  28.41 
 
 
681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  29.05 
 
 
676 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  28.69 
 
 
687 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  27.05 
 
 
695 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  28.52 
 
 
692 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  27.08 
 
 
741 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  33.17 
 
 
470 aa  99.8  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  29.03 
 
 
480 aa  99.8  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  27.94 
 
 
475 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  29.39 
 
 
523 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  30.08 
 
 
533 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  27.94 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  31.11 
 
 
464 aa  96.7  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  30.28 
 
 
468 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  32.17 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  28.63 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  26.71 
 
 
648 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  29.39 
 
 
472 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  31.87 
 
 
503 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  27.11 
 
 
569 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  28.81 
 
 
473 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  30.28 
 
 
447 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  30.83 
 
 
462 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  28.81 
 
 
475 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  31.85 
 
 
435 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  26.88 
 
 
640 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  28.81 
 
 
473 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  27.95 
 
 
477 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  27.56 
 
 
477 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  26.56 
 
 
640 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  31.47 
 
 
460 aa  90.9  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  30.58 
 
 
429 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  29.44 
 
 
645 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  26.54 
 
 
695 aa  90.5  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  30.42 
 
 
465 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  27.56 
 
 
503 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  26.06 
 
 
674 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  30 
 
 
490 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  31.87 
 
 
646 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  27.76 
 
 
475 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  28.74 
 
 
651 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  25.67 
 
 
699 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  28.74 
 
 
651 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  26.49 
 
 
676 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  32.35 
 
 
464 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  33.18 
 
 
656 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  30.77 
 
 
430 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  25.7 
 
 
681 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  27.38 
 
 
651 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  30.81 
 
 
581 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  33 
 
 
438 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  30.1 
 
 
436 aa  87  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  40.62 
 
 
754 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  24.91 
 
 
470 aa  86.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  33.49 
 
 
404 aa  86.3  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  33.66 
 
 
482 aa  86.7  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  25.4 
 
 
697 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  25.4 
 
 
697 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  26.02 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  31.62 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  40.91 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  28.69 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  28.57 
 
 
665 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  40.34 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  29.67 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  33.03 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  31.2 
 
 
454 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  32.9 
 
 
577 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  32.9 
 
 
577 aa  84  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  31.2 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  30.63 
 
 
615 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  29.33 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  25.35 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  30.65 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  33.01 
 
 
439 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  29.33 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  30.1 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  28.99 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  30.49 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  32.08 
 
 
458 aa  82  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  30.88 
 
 
621 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  41.75 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  32.88 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  29.92 
 
 
683 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  27.73 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  27.94 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  27.11 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  29.38 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  28.02 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  27.2 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  30.84 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  28.03 
 
 
479 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  28.51 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  29.93 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>