More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3812 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3812  Peptidase M23  100 
 
 
404 aa  784    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3671  hypothetical protein  88.21 
 
 
406 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.254615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3729  Peptidase M23  100 
 
 
413 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3799  peptidase M23B  60.84 
 
 
399 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  30.22 
 
 
690 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  29.15 
 
 
681 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  29.01 
 
 
680 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  28.63 
 
 
676 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  28.28 
 
 
687 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  27.46 
 
 
695 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  28.41 
 
 
692 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  27.94 
 
 
475 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  28.57 
 
 
480 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  28.79 
 
 
533 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  27.94 
 
 
474 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  28.98 
 
 
523 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  30.28 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  29.41 
 
 
741 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  29.39 
 
 
472 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  28.81 
 
 
473 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  27.02 
 
 
569 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  29.87 
 
 
460 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  30.28 
 
 
447 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  28.81 
 
 
475 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  28.81 
 
 
473 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  31.66 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  26.14 
 
 
648 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  31.45 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  31.87 
 
 
503 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  27.78 
 
 
517 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  26.88 
 
 
640 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  27.94 
 
 
503 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  29.96 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  28.05 
 
 
475 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  26.25 
 
 
676 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  30.04 
 
 
465 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  39.84 
 
 
754 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  30.77 
 
 
464 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  33.97 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  26.17 
 
 
640 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  30.77 
 
 
645 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  30.31 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  32.26 
 
 
430 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  28.51 
 
 
477 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  28.1 
 
 
477 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  33.66 
 
 
482 aa  86.7  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  31.32 
 
 
646 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  29.11 
 
 
441 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  26.42 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  31.09 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  33.5 
 
 
656 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  30 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  41.82 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  26.09 
 
 
674 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  25.29 
 
 
699 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  25.7 
 
 
681 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  31.58 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  33 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  25.48 
 
 
695 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  33.49 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  26.59 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  30 
 
 
581 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  39.5 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  29.64 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  31.47 
 
 
615 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  29.19 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  24.83 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  25 
 
 
697 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  27.47 
 
 
437 aa  82.8  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  25 
 
 
697 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  27.59 
 
 
651 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  27.6 
 
 
665 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  27.59 
 
 
651 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  26.24 
 
 
651 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  29.08 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  32.26 
 
 
577 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  28.85 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  30.46 
 
 
621 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  32.26 
 
 
577 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  30.56 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  29.41 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  29.59 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  32.88 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  29.41 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  31.6 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  30.04 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40.78 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  27.73 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  27.42 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  30.04 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  29.84 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  28.21 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  42.31 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  29.56 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  32.26 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  28.51 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  28.37 
 
 
490 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  27.97 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  32.45 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  28.63 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>