More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2700 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2700  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 291 aa  544  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.782483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2793  DNA protecting protein DprA  94.79 
 
 		 312 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2886  DNA protecting protein DprA  92.78 
 
 		 320 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2694  DNA protecting protein DprA  68.66 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0256425  normal  0.190836 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  42.03 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  37.92 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  47.77 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  36.93 
 
 		 360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  46.02 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  36.93 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  44.64 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  46.35 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.49 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.16 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.77 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  44.89 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.4 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.07 
 
 		 361 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 379 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.89 
 
 		 356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.88 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  44.09 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.11 
 
 		 364 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  46.13 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.33 
 
 		 373 aa  178  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  38.19 
 
 		 365 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  41.11 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.24 
 
 		 373 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 360 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.96 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  42.05 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.49 
 
 		 377 aa  175  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  37.59 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 359 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.13 
 
 		 362 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.59 
 
 		 372 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.31 
 
 		 368 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  40.89 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.84 
 
 		 389 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.24 
 
 		 409 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.35 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  38.41 
 
 		 399 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40.35 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 394 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  40.46 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  45.13 
 
 		 366 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  37.32 
 
 		 369 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  40.46 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  41 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  44.72 
 
 		 362 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.28 
 
 		 362 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  40.6 
 
 		 373 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  40.6 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  41.9 
 
 		 338 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  38.6 
 
 		 361 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 374 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  39.86 
 
 		 374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  38.24 
 
 		 361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  39.86 
 
 		 374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  45.16 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  44.73 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 		 434 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  48.4 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.86 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  40.69 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  40.57 
 
 		 372 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 374 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  42.6 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  43.48 
 
 		 362 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  32.14 
 
 		 363 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  30.42 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.76 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  49.28 
 
 		 433 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  44.3 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 389 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 405 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  41.44 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>