More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1865 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1865  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  100 
 
 
241 aa  450  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2080  pseudouridine synthase  93.75 
 
 
241 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1995  pseudouridine synthase  92.5 
 
 
241 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1974  pseudouridine synthase  71.11 
 
 
238 aa  291  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  45.22 
 
 
235 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.32 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  40.82 
 
 
344 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  40.41 
 
 
344 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  40.33 
 
 
346 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1202  pseudouridine synthase  36.99 
 
 
247 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.0231079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  42.8 
 
 
331 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41 
 
 
391 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1072  RluA family pseudouridine synthase  39.16 
 
 
349 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0863187  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  41.5 
 
 
345 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  40.17 
 
 
389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.17 
 
 
395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  40.17 
 
 
389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2274  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  40.32 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.17 
 
 
395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  40.17 
 
 
389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  40.17 
 
 
389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  40.17 
 
 
395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  42.5 
 
 
399 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  42.62 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  49.15 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3085  RluA family pseudouridine synthase  39.67 
 
 
398 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  43.15 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  40.59 
 
 
339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  40.43 
 
 
362 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  48.29 
 
 
302 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  38.21 
 
 
319 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  38.33 
 
 
407 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  39.68 
 
 
338 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122309  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  38.33 
 
 
405 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  37.8 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2409  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.49 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.33 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  38.33 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  38.33 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  38.33 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.33 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  45.92 
 
 
316 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  35.34 
 
 
325 aa  125  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.75 
 
 
438 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  37.5 
 
 
400 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3654  pseudouridine synthase  39.66 
 
 
225 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3659  pseudouridine synthase, RluD  38.96 
 
 
378 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0921  RluA family pseudouridine synthase  38.1 
 
 
318 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  37.92 
 
 
360 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1005  RluA family pseudouridine synthase  39.13 
 
 
343 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  39.42 
 
 
436 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3046  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.09 
 
 
332 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  39.92 
 
 
315 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3012  RluA family pseudouridine synthase  41.37 
 
 
311 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17598  normal  0.601739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.4 
 
 
318 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2192  RluA family pseudouridine synthase  41.8 
 
 
316 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677227  normal  0.0743981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  38.33 
 
 
431 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.39 
 
 
343 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2406  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.37 
 
 
335 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0234677  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  50 
 
 
298 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.34 
 
 
403 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0968  pseudouridine synthase, RluA family  38.74 
 
 
343 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0155  pseudouridine synthase  37.44 
 
 
215 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1506  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  37.44 
 
 
215 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  36.1 
 
 
318 aa  121  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.02 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  38.68 
 
 
331 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  33.98 
 
 
336 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  39.26 
 
 
353 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2909  pseudouridine synthase  36.73 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.290818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  40.98 
 
 
370 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0494  pseudouridine synthase  37.6 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0348  RluA family pseudouridine synthase  38.82 
 
 
346 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  36.68 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0473  pseudouridine synthase, RluA family  37.65 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500273 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0921  pseudouridine synthase, RluA family  35.22 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1563  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.13 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.151804 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0195  pseudouridine synthase, RluD  48.7 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0653986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2118  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.23 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.96 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  36.95 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0912  pseudouridine synthase, RluA family  37.8 
 
 
558 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00634483 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.26 
 
 
315 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2550  pseudouridine synthase, RluD  38.02 
 
 
319 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.347335  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0771  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.98 
 
 
323 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.497941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  39.41 
 
 
322 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 
370 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0992  RluA family pseudouridine synthase  40.08 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  39.68 
 
 
334 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  38.66 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0988  RluA family pseudouridine synthase  40.16 
 
 
334 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  37.19 
 
 
313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2215  RluA family pseudouridine synthase  36.78 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1322  pseudouridine synthase, RluD  39.57 
 
 
326 aa  118  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381101  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  37.24 
 
 
370 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02339  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase  39.66 
 
 
313 aa  118  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.336245  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1194  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.98 
 
 
323 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  36.4 
 
 
376 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0632  pseudouridine synthase, RluD  39.75 
 
 
334 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1112  RluA family pseudouridine synthase  39.75 
 
 
334 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>