More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1119 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1119  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  230  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1247  response regulator receiver protein  95.87 
 
 		 129 aa  211  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.496666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1179  response regulator receiver protein  95.8 
 
 		 119 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1159  response regulator receiver protein  70.19 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  40.66 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 1066 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.91 
 
 		 486 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  42.73 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  29.27 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 256 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  31.09 
 
 		 391 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 476 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 795 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 310 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0087  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.010948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.93 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  40.91 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 645 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 770 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  41.77 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  41.77 
 
 		 982 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 783 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 827 aa  68.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 721 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 574 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1223 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  42.86 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.03 
 
 		 466 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  40.48 
 
 		 386 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  35.29 
 
 		 513 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  33.96 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.23 
 
 		 335 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1362 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  41.9 
 
 		 230 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 530 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  39.51 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  42.24 
 
 		 1427 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 890 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 375 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  43.69 
 
 		 234 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 1164 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  33.65 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.57 
 
 		 1629 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.47 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  36.89 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2954  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  36.05 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0548  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  34.75 
 
 		 570 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2077  vncR, response regulator  30.77 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00119329  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.27 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  41.07 
 
 		 1164 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.47 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  32.52 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3402  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.219481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  37.38 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1352 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  37.7 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  36.89 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 564 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  33.9 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  36.89 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  36.89 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 457 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.21 
 
 		 453 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  35.25 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  38.37 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1011 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.31 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5208  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000457636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  44 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>