More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1130 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  42.97 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  55.65 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  54.78 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  40.56 
 
 		 248 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  50.39 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  50.39 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  50.88 
 
 		 176 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  54.21 
 
 		 233 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  47.24 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  49.12 
 
 		 176 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  41.33 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  52.07 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  49.62 
 
 		 174 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  58.25 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  47.29 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  47.29 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  47.58 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  48.78 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  49.55 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  50.43 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  47.37 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  45.38 
 
 		 154 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  40.6 
 
 		 163 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  50.79 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  45.37 
 
 		 158 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  39.13 
 
 		 182 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  42.28 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  41.27 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  38.33 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  48.7 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  38.21 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  36.07 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  38.32 
 
 		 173 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  36.15 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  54.93 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  41.24 
 
 		 348 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.4 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  41.12 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  41.12 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  41.12 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.94 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  35.85 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  39.22 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  37 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  40.62 
 
 		 175 aa  72  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  35.07 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.87 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  34.4 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.07 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.16 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.09 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  37.39 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.47 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  36.96 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  36.73 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  40.45 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  31.3 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.11 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  30.94 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1819  hypothetical protein  29.63 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.245633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  26.59 
 
 		 860 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  29.1 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2088  protein of unknown function DUF1003  37.04 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000793332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  30.51 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  28.78 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.14 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  32.99 
 
 		 180 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.15 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.49 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.83 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  33.96 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.6 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  35.06 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  33.63 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.69 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  25.3 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>