88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3811 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 
236 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  47.69 
 
 
286 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  46.51 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  50.97 
 
 
217 aa  218  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  49.03 
 
 
237 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  49.3 
 
 
233 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  45.07 
 
 
248 aa  201  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  44.71 
 
 
235 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  44.71 
 
 
235 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  49.55 
 
 
232 aa  196  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  46.77 
 
 
263 aa  195  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  45.62 
 
 
240 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  50.98 
 
 
178 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  50 
 
 
183 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  38.84 
 
 
293 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  39.66 
 
 
246 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  37.61 
 
 
256 aa  159  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  50 
 
 
176 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  52.82 
 
 
174 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  47.83 
 
 
176 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  44 
 
 
196 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  53.02 
 
 
202 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  55.37 
 
 
286 aa  131  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  41.73 
 
 
177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  44.51 
 
 
191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  52.21 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  53 
 
 
182 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  50.79 
 
 
276 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  50.44 
 
 
158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  49.12 
 
 
163 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  47.75 
 
 
219 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  35.82 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  38.38 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  35.51 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  35.51 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  35.51 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  38.24 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  37.21 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  31.25 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  35.64 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  34.62 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  36.27 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  35.64 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  35.35 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  34.65 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  39.51 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  31.73 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  33.07 
 
 
166 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  32.32 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  33 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  36.75 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  39.18 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  31.68 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  38.75 
 
 
176 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  29.2 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1819  hypothetical protein  29.46 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.245633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  29.29 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11280  predicted membrane protein  31.93 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0638303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  37.66 
 
 
158 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2088  protein of unknown function DUF1003  38.27 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000793332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  35.71 
 
 
181 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  31.96 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19380  predicted membrane protein  35.8 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259397  normal  0.0169508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2791  hypothetical protein  32.18 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0480171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  30.94 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  27.93 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  37.08 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  34.88 
 
 
175 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  28.47 
 
 
184 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2511  protein of unknown function DUF1003  30.95 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000601993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  33.33 
 
 
188 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  32.1 
 
 
168 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  31.06 
 
 
182 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  30.53 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  32.22 
 
 
200 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15340  predicted membrane protein  26.32 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  33 
 
 
174 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  27.96 
 
 
188 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  25.4 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  27.96 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  29.47 
 
 
190 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3499  protein of unknown function DUF1003  32 
 
 
174 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  25.45 
 
 
190 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>