82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1489 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  77.33 
 
 		 154 aa  247  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  76.03 
 
 		 158 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  45.7 
 
 		 196 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  55.88 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  48.12 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  40.58 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  47.12 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  41.86 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  47.5 
 
 		 233 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  48.72 
 
 		 286 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  50.86 
 
 		 217 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  48.11 
 
 		 235 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  48.11 
 
 		 235 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  42.42 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  46.9 
 
 		 246 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  45.28 
 
 		 301 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  47.32 
 
 		 293 aa  103  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  47.17 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  43.75 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  47.97 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  47.41 
 
 		 237 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  44.34 
 
 		 286 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  45.19 
 
 		 263 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  40.6 
 
 		 276 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  40.77 
 
 		 235 aa  98.6  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  47.93 
 
 		 219 aa  98.6  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  47.32 
 
 		 256 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  49.12 
 
 		 236 aa  95.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  45.8 
 
 		 202 aa  94  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  40.19 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  34.25 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  44.83 
 
 		 240 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  32.81 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  29.77 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  36 
 
 		 348 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  39.09 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  35.29 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  35.19 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  31.78 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  31.08 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  31.78 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  31.78 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  37.04 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  27.94 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  40.54 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  36.27 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  40.26 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  31.33 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  33.96 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11280  predicted membrane protein  30.53 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0638303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  31.85 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1819  hypothetical protein  29.2 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.245633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  40.43 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  29.25 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  32.11 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  31.67 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3499  protein of unknown function DUF1003  30.37 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  31.03 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  31.67 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  45.33 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  30.37 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  34.29 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  27.54 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  30.08 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  29.13 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  28 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2511  protein of unknown function DUF1003  28.57 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000601993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  28.57 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2791  hypothetical protein  28.46 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0480171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19380  predicted membrane protein  26.36 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259397  normal  0.0169508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15340  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  27.1 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  23.94 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  32.1 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2088  protein of unknown function DUF1003  30.68 
 
 		 116 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000793332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  24.65 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  24.46 
 
 		 190 aa  40.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>