63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2511 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2511  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 
235 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000601993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2791  hypothetical protein  85.15 
 
 
236 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0480171  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15340  predicted membrane protein  71.52 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  66.67 
 
 
168 aa  223  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  61.11 
 
 
199 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  67.11 
 
 
173 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  60 
 
 
181 aa  211  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  61.54 
 
 
225 aa  211  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  59.88 
 
 
175 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19380  predicted membrane protein  65.75 
 
 
256 aa  198  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259397  normal  0.0169508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11280  predicted membrane protein  59.87 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0638303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  58.67 
 
 
177 aa  178  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  57.89 
 
 
166 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  52.22 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  53.85 
 
 
180 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  57.72 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  58.52 
 
 
156 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  52.98 
 
 
209 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  54.89 
 
 
203 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  49.1 
 
 
188 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1819  hypothetical protein  46.78 
 
 
202 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.245633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  51.11 
 
 
196 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  47.67 
 
 
181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  44.57 
 
 
181 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  46.43 
 
 
167 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  53.19 
 
 
171 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  53.19 
 
 
171 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  53.19 
 
 
171 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  53.03 
 
 
173 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  47.37 
 
 
176 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  45.86 
 
 
348 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  41.67 
 
 
175 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  45.62 
 
 
296 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  47.4 
 
 
180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  43.96 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  43.96 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  30.83 
 
 
158 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  31.06 
 
 
154 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  32.5 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  28.57 
 
 
163 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  35.24 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  31.76 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  33.67 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  32.95 
 
 
176 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  32.95 
 
 
176 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  27.74 
 
 
263 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  31.33 
 
 
183 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  33.72 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  27.41 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  35.71 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  29.41 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  33.33 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  36.84 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  32.56 
 
 
301 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  32.1 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  32.1 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  35.64 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  23.71 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  31.17 
 
 
293 aa  45.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 
276 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  31.07 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  26.17 
 
 
174 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  31.03 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>