58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2595 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3499  protein of unknown function DUF1003  90.8 
 
 		 174 aa  326  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  30.37 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  28.89 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7120  hypothetical protein  38.6 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  28.93 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  28.28 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  29.82 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1911  hypothetical protein  26.22 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  26.19 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  32.65 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  29.2 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  35.11 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11280  predicted membrane protein  30.77 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0638303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  37.11 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  29.7 
 
 		 233 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  31.07 
 
 		 301 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  31.69 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  28.04 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  30.25 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  27.43 
 
 		 219 aa  51.2  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  29.25 
 
 		 286 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  29.92 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  31.68 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  26.77 
 
 		 248 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  31.11 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  31.43 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  31.43 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  32.08 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  28.04 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  26.17 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  28.46 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  30.59 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  24.59 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19380  predicted membrane protein  33.87 
 
 		 256 aa  45.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259397  normal  0.0169508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  35.11 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2511  protein of unknown function DUF1003  31.07 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000601993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  30.21 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  29.31 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  25 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  27.1 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2791  hypothetical protein  29.52 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0480171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  28.68 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  25.93 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  30.39 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  28.07 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  30.56 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  28.12 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 276 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  25.78 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  26.8 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  35.71 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  27.36 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  33.67 
 
 		 188 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>