52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2139 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  98.4 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  91.49 
 
 		 188 aa  345  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  87.57 
 
 		 190 aa  305  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  60.36 
 
 		 183 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  59.2 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  58.66 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  59.63 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  55.42 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  50 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  50.96 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  40.38 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  37.66 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  41.67 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  48.51 
 
 		 178 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  29.79 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  30.43 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  27.35 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  37.14 
 
 		 348 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  27.91 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  25.18 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  29.29 
 
 		 235 aa  48.5  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  32.86 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  33.82 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  32.86 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  36.62 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  32.08 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  34.78 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  34 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  23.72 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  31.13 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  27.88 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  30.99 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  27.48 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  28.03 
 
 		 233 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  31.17 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  30.39 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  31.17 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  26.13 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  25.18 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  31.17 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  30.12 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  33.62 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  28.93 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  29.09 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  27.84 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  29.41 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  34.33 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  22.66 
 
 		 276 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  26.8 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>