63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2219 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  59.22 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  58.66 
 
 		 188 aa  204  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  58.82 
 
 		 183 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  54.84 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  57.8 
 
 		 188 aa  197  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  63.75 
 
 		 190 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  63.75 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  55.93 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  50.61 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  52.53 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  41.89 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  44.62 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  39.69 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  42.4 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  31.86 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  32.81 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  34.19 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  36.27 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  32.41 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  30.37 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  29.66 
 
 		 263 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  29.93 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  33.33 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  30.69 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  28.67 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  35.94 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  33.67 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  33.01 
 
 		 237 aa  48.5  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  32.32 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  27.55 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  32.5 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  32.39 
 
 		 167 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  37.68 
 
 		 348 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  39.13 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  29.59 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  33.01 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3499  protein of unknown function DUF1003  34.65 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  35 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  24.65 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  29.7 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  34.51 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  31.88 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  28.24 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  29.31 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  29.81 
 
 		 256 aa  44.7  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  25.37 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  27.18 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  30.14 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  31.06 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  31.19 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  35.94 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  30.39 
 
 		 178 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  27.61 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  28.77 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  24.56 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>