68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5575 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  58.33 
 
 		 200 aa  194  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  55.06 
 
 		 188 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  60.74 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  55.42 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  55.42 
 
 		 188 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  57.06 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  53.25 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  55.93 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  56.21 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  57.76 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  40.25 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  37.97 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  43.65 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  34.17 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  33.08 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  29.3 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  27.97 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  30.91 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  29.77 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  32.28 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  32.99 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  37.11 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  37.11 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  32.26 
 
 		 248 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  29.31 
 
 		 293 aa  52.4  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  26.03 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  35.42 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  32.03 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  25.34 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  29.46 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  30.39 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  32.32 
 
 		 301 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  28.21 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  32.06 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  29.45 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  33.78 
 
 		 348 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  27.36 
 
 		 246 aa  48.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  32.43 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  30.83 
 
 		 296 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  29.73 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  31.31 
 
 		 286 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  25.16 
 
 		 256 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  27.45 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  24.09 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  27.18 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  33.65 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  28.15 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  27.34 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19380  predicted membrane protein  28.95 
 
 		 256 aa  45.1  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259397  normal  0.0169508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  27.03 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  28.83 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  26.24 
 
 		 175 aa  44.3  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  28.75 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  31.25 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  31.52 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  28.46 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  31.07 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  31.43 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  25.35 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  23.94 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  29.41 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  28.85 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  24.8 
 
 		 276 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  26.56 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  28.15 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>