46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0848 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  56.25 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  59.2 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  58.62 
 
 		 188 aa  201  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  56.32 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  54.84 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  59.06 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  55.06 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  50.87 
 
 		 183 aa  177  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  50.28 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  51.55 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  43.88 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  35.44 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  44.63 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  41.91 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  29.77 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  35.14 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  29.53 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  35.05 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  29.85 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  31.19 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  27.04 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  30.69 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  32.8 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  29.81 
 
 		 301 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  34.62 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  30.1 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  32.26 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  28.69 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  33.67 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  25.19 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  31.87 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  30 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  28.85 
 
 		 286 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  35.11 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  28.89 
 
 		 293 aa  44.7  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  29.63 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  28.57 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  33.73 
 
 		 348 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  33.04 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  23.7 
 
 		 276 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  31.63 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>