27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4151 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  56.25 
 
 		 188 aa  209  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  51.88 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  47.03 
 
 		 188 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  53.25 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  50 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  48.82 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  47.8 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  50.61 
 
 		 188 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  44.25 
 
 		 200 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  36.31 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  36.94 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  40.77 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  45.45 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  37 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  37.25 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  29.75 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  25.69 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  30.21 
 
 		 263 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  28.44 
 
 		 233 aa  47.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  26.37 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  31.78 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  26.89 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 286 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>