42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1755 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 188 aa  376  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  92.55 
 
 		 188 aa  348  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  91.49 
 
 		 188 aa  345  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  87.91 
 
 		 190 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  59.76 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  56.32 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  57.8 
 
 		 188 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  47.03 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  55.9 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  56.21 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  49.04 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  37.86 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  37.66 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  40.15 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  42.75 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  29.08 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  31.45 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  27.48 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  33 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  29 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  25.98 
 
 		 246 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  33 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  32.86 
 
 		 296 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  32.35 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  32.86 
 
 		 348 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  31.43 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  31.53 
 
 		 240 aa  44.7  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  28.79 
 
 		 233 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  30 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  27.62 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  27.88 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  28.17 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  24.48 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  27.48 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  29.25 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  30.99 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  31 
 
 		 196 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  29.91 
 
 		 178 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>