87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1664 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  77.36 
 
 
217 aa  351  5e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  66.37 
 
 
240 aa  316  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  45.18 
 
 
301 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  44.3 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  47.93 
 
 
263 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  45.25 
 
 
248 aa  208  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  48.26 
 
 
233 aa  205  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  45.58 
 
 
232 aa  201  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  45.21 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  45.21 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  49.03 
 
 
236 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  50.84 
 
 
178 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  47.1 
 
 
176 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  46.45 
 
 
176 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  45.62 
 
 
183 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  38.92 
 
 
246 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  44.07 
 
 
235 aa  141  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  47.26 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  51.82 
 
 
174 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  61.21 
 
 
286 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  51.59 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  37.87 
 
 
177 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  51.25 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  32.91 
 
 
293 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  58.1 
 
 
191 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  52.59 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  50.39 
 
 
276 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  55.45 
 
 
154 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  56.44 
 
 
158 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  53.04 
 
 
182 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  47.41 
 
 
163 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  40.83 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  31.06 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  38.04 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  40.7 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  42.86 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  44.44 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  44.59 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  35.71 
 
 
177 aa  72  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  39 
 
 
156 aa  72  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  33.87 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  41.86 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  41.86 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  41.86 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  31.51 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  40.23 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  41.25 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  32.54 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  35.66 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  42.5 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2088  protein of unknown function DUF1003  42.86 
 
 
116 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000793332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  35.71 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  37.04 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1819  hypothetical protein  31.78 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.245633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19380  predicted membrane protein  38.2 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259397  normal  0.0169508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  35.56 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  38.75 
 
 
158 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  42.67 
 
 
180 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  36.28 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11280  predicted membrane protein  37.08 
 
 
198 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0638303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  28.79 
 
 
188 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  39.08 
 
 
175 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  32.69 
 
 
178 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  36.9 
 
 
173 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  33.33 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2511  protein of unknown function DUF1003  33.67 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000601993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  34.74 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  32.28 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  37.84 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  37.25 
 
 
182 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  37.84 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2791  hypothetical protein  35.44 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0480171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  35.63 
 
 
199 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  36.14 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  37.97 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15340  predicted membrane protein  26.01 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  34 
 
 
183 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  32.35 
 
 
174 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3499  protein of unknown function DUF1003  33.65 
 
 
174 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  32.32 
 
 
190 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  27.88 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  27.88 
 
 
188 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  26.4 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  27.88 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>