42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1548 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  88.04 
 
 		 188 aa  327  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  88.04 
 
 		 188 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  87.91 
 
 		 188 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  59.06 
 
 		 188 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  59.76 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  63.75 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  57.06 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  57.14 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  48.82 
 
 		 182 aa  161  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  49.68 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  36.67 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  34.59 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  49.52 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  45.71 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  28.78 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  27.86 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  31.96 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  25.77 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  27.78 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  32.03 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  30.47 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  26.32 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  32.86 
 
 		 348 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  26.14 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  29.25 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  29.84 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  24.66 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  32.39 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  29.71 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  28.17 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  30.88 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  30.43 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  24.76 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  28.99 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  28.03 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  27.14 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  30.28 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  25.18 
 
 		 163 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>